Protein–RNA interactions for Protein: P56501

Ucp3, Mitochondrial uncoupling protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ucp3P56501 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ucp3P56501 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ucp3P56501 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ucp3P56501 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ucp3P56501 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ucp3P56501 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ucp3P56501 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ucp3P56501 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ucp3P56501 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms