Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bmp8bP55105 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bmp8bP55105 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bmp8bP55105 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmp8bP55105 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bmp8bP55105 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmp8bP55105 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmp8bP55105 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bmp8bP55105 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms