Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr1cP52432 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1cP52432 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1cP52432 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1cP52432 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr1cP52432 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms