Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Defa-rs12P50716 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Defa-rs12P50716 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Defa-rs12P50716 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Defa-rs12P50716 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Defa-rs12P50716 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Defa-rs12P50716 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms