Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Csrp3P50462 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csrp3P50462 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csrp3P50462 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csrp3P50462 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrp3P50462 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrp3P50462 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms