Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcd1P48410 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcd1P48410 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcd1P48410 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcd1P48410 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcd1P48410 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcd1P48410 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms