Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx2P48379 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfx2P48379 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx2P48379 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx2P48379 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx2P48379 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx2P48379 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms