Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli1P47806 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gli1P47806 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli1P47806 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gli1P47806 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli1P47806 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gli1P47806 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli1P47806 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli1P47806 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli1P47806 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli1P47806 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli1P47806 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli1P47806 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli1P47806 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli1P47806 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms