Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 GPM1YKL152C 744 nt8.38□□□□□ -1.07
SEC28P40509 STP3YLR375W 1032 nt8.37□□□□□ -1.07
SEC28P40509 YMC2YBR104W 990 nt8.37□□□□□ -1.07
SEC28P40509 PAR32YDL173W 888 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC28P40509 YKR012CYKR012C 378 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC28P40509 REX2YLR059C 810 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC28P40509 SAN1YDR143C 1833 nt8.36□□□□□ -1.07
SEC28P40509 GGA2YHR108W 1758 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC28P40509 YBL095WYBL095W 813 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC28P40509 MTO1YGL236C 2010 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC28P40509 THP3YPR045C 1413 nt8.35□□□□□ -1.07
SEC28P40509 HXK1YFR053C 1458 nt8.34□□□□□ -1.07
SEC28P40509 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SEC28P40509 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.34□□□□□ -1.07
SEC28P40509 FSH2YMR222C 672 nt8.34□□□□□ -1.07
SEC28P40509 NPP2YEL016C 1482 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC28P40509 YHL008CYHL008C 1884 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC28P40509 ESS1YJR017C 513 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC28P40509 PGC1YPL206C 966 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC28P40509 GAS1YMR307W 1680 nt8.33□□□□□ -1.08
SEC28P40509 PTC6YCR079W 1329 nt8.32□□□□□ -1.08
SEC28P40509 NAS2YIL007C 663 nt8.32□□□□□ -1.08
SEC28P40509 YPT11YNL304W 1254 nt8.31□□□□□ -1.08
SEC28P40509 IGD1YFR017C 588 nt8.3□□□□□ -1.08
SEC28P40509 THI3YDL080C 1830 nt8.29□□□□□ -1.08
SEC28P40509 RTG2YGL252C 1767 nt8.28□□□□□ -1.08
SEC28P40509 MOB1YIL106W 945 nt8.28□□□□□ -1.08
SEC28P40509 NBA1YOL070C 1506 nt8.28□□□□□ -1.08
SEC28P40509 MRS4YKR052C 915 nt8.27□□□□□ -1.09
SEC28P40509 AAT1YKL106W 1356 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC28P40509 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.26□□□□□ -1.09
SEC28P40509 THI6YPL214C 1623 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC28P40509 RSM7YJR113C 744 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC28P40509 ADH3YMR083W 1128 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC28P40509 ALD5YER073W 1563 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC28P40509 SDS24YBR214W 1584 nt8.25□□□□□ -1.09
SEC28P40509 YBR232CYBR232C 360 nt8.24□□□□□ -1.09
SEC28P40509 ENO1YGR254W 1314 nt8.24□□□□□ -1.09
SEC28P40509 ALR1YOL130W 2580 nt8.23□□□□□ -1.09
SEC28P40509 LYS20YDL182W 1287 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC28P40509 PHB2YGR231C 933 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC28P40509 EMC3YKL207W 762 nt8.22□□□□□ -1.09
SEC28P40509 VBA3YCL069W 1377 nt8.21□□□□□ -1.1
SEC28P40509 YJL009WYJL009W 327 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC28P40509 CDD1YLR245C 429 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC28P40509 SNU66YOR308C 1764 nt8.2□□□□□ -1.1
SEC28P40509 TRP2YER090W 1524 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC28P40509 GCD11YER025W 1584 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC28P40509 YOR072WYOR072W 315 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC28P40509 DUR3YHL016C 2208 nt8.19□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 SEN2YLR105C 1134 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 IPL1YPL209C 1104 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 AAC3YBR085W 924 nt8.18□□□□□ -1.1
SEC28P40509 YCR025CYCR025C 411 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC28P40509 FLX1YIL134W 936 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC28P40509 CYC3YAL039C 810 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC28P40509 ADE2YOR128C 1716 nt8.17□□□□□ -1.1
SEC28P40509 TMS1YDR105C 1422 nt8.15□□□□□ -1.1
SEC28P40509 YJR149WYJR149W 1215 nt8.15□□□□□ -1.1
SEC28P40509 YLR460CYLR460C 1131 nt8.15□□□□□ -1.1
SEC28P40509 FET5YFL041W 1869 nt8.15□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.14□□□□□ -1.11
SEC28P40509 YIR035CYIR035C 765 nt8.13□□□□□ -1.11
SEC28P40509 YLR280CYLR280C 351 nt8.13□□□□□ -1.11
SEC28P40509 snR86snR86 1004 nt8.12□□□□□ -1.11
SEC28P40509 YFR020WYFR020W 699 nt8.12□□□□□ -1.11
SEC28P40509 MIM1YOL026C 342 nt8.12□□□□□ -1.11
SEC28P40509 YJL064WYJL064W 396 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC28P40509 NAP1YKR048C 1254 nt8.11□□□□□ -1.11
SEC28P40509 BUB2YMR055C 921 nt8.1□□□□□ -1.11
SEC28P40509 HXT11YOL156W 1704 nt8.09□□□□□ -1.11
SEC28P40509 SRP102YKL154W 735 nt8.09□□□□□ -1.11
SEC28P40509 MAM3YOL060C 2121 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC28P40509 OLA1YBR025C 1185 nt8.08□□□□□ -1.12
SEC28P40509 CHS7YHR142W 951 nt8.07□□□□□ -1.12
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