Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ly6dP35459 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ly6dP35459 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ly6dP35459 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ly6dP35459 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ly6dP35459 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ly6dP35459 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ly6dP35459 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ly6dP35459 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms