Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BgnP28653 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BgnP28653 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BgnP28653 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BgnP28653 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BgnP28653 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BgnP28653 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BgnP28653 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BgnP28653 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BgnP28653 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BgnP28653 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BgnP28653 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BgnP28653 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BgnP28653 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BgnP28653 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BgnP28653 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BgnP28653 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BgnP28653 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BgnP28653 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BgnP28653 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BgnP28653 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BgnP28653 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BgnP28653 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BgnP28653 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BgnP28653 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BgnP28653 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BgnP28653 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BgnP28653 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BgnP28653 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BgnP28653 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BgnP28653 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BgnP28653 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BgnP28653 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BgnP28653 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BgnP28653 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BgnP28653 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BgnP28653 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BgnP28653 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BgnP28653 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BgnP28653 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BgnP28653 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BgnP28653 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BgnP28653 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BgnP28653 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BgnP28653 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BgnP28653 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BgnP28653 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BgnP28653 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BgnP28653 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BgnP28653 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BgnP28653 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BgnP28653 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BgnP28653 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BgnP28653 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BgnP28653 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BgnP28653 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BgnP28653 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BgnP28653 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BgnP28653 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BgnP28653 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BgnP28653 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BgnP28653 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BgnP28653 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BgnP28653 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BgnP28653 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BgnP28653 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BgnP28653 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BgnP28653 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BgnP28653 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BgnP28653 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BgnP28653 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BgnP28653 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BgnP28653 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BgnP28653 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BgnP28653 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BgnP28653 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BgnP28653 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BgnP28653 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BgnP28653 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BgnP28653 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BgnP28653 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BgnP28653 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BgnP28653 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BgnP28653 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BgnP28653 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BgnP28653 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BgnP28653 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BgnP28653 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BgnP28653 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BgnP28653 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BgnP28653 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BgnP28653 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BgnP28653 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BgnP28653 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms