Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3P21107 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3P21107 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm3P21107 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3P21107 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3P21107 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpm3P21107 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpm3P21107 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms