Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cox4i1P19783 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox4i1P19783 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox4i1P19783 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox4i1P19783 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cox4i1P19783 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cox4i1P19783 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cox4i1P19783 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cox4i1P19783 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cox4i1P19783 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox4i1P19783 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms