Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnc1P19123 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnnc1P19123 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnnc1P19123 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnc1P19123 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnc1P19123 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnnc1P19123 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms