Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpsaP14206 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpsaP14206 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpsaP14206 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpsaP14206 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpsaP14206 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RpsaP14206 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpsaP14206 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpsaP14206 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpsaP14206 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpsaP14206 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpsaP14206 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpsaP14206 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpsaP14206 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpsaP14206 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms