Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctla2aP12399 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctla2aP12399 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctla2aP12399 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctla2aP12399 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctla2aP12399 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctla2aP12399 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms