Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lamp1P11438 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lamp1P11438 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamp1P11438 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamp1P11438 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamp1P11438 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamp1P11438 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamp1P11438 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lamp1P11438 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamp1P11438 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamp1P11438 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamp1P11438 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lamp1P11438 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamp1P11438 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamp1P11438 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lamp1P11438 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamp1P11438 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamp1P11438 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamp1P11438 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lamp1P11438 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lamp1P11438 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lamp1P11438 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms