Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Jmjd7P0C872 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd7P0C872 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd7P0C872 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Jmjd7P0C872 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd7P0C872 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd7P0C872 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms