Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gap43P06837 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gap43P06837 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gap43P06837 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gap43P06837 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gap43P06837 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gap43P06837 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gap43P06837 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gap43P06837 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gap43P06837 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gap43P06837 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gap43P06837 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gap43P06837 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gap43P06837 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gap43P06837 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gap43P06837 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gap43P06837 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gap43P06837 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gap43P06837 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms