Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06320 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06320 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P06320 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
P06320 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06320 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06320 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06320 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06320 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06320 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06320 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06320 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06320 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06320 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06320 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06320 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06320 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06320 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06320 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06320 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06320 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06320 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06320 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06320 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06320 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06320 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P06320 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06320 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06320 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06320 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06320 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06320 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06320 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P06320 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P06320 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06320 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06320 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06320 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P06320 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P06320 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06320 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06320 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P06320 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P06320 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06320 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06320 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P06320 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P06320 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06320 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06320 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P06320 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06320 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06320 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06320 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06320 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06320 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06320 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06320 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06320 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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