Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtnd1P03888 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtnd1P03888 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtnd1P03888 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtnd1P03888 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mtnd1P03888 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mtnd1P03888 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms