Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ighg1P01869 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ighg1P01869 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighg1P01869 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ighg1P01869 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighg1P01869 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighg1P01869 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighg1P01869 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ighg1P01869 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighg1P01869 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighg1P01869 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ighg1P01869 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighg1P01869 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ighg1P01869 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighg1P01869 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighg1P01869 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighg1P01869 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighg1P01869 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ighg1P01869 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ighg1P01869 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighg1P01869 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighg1P01869 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ighg1P01869 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms