Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01645 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01645 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01645 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
P01645 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01645 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01645 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01645 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01645 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P01645 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P01645 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P01645 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P01645 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01645 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01645 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01645 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01645 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01645 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01645 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P01645 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
P01645 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
P01645 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
P01645 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P01645 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
P01645 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01645 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01645 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01645 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01645 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01645 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01645 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01645 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01645 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01645 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01645 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P01645 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P01645 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P01645 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01645 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01645 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01645 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01645 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01645 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P01645 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P01645 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P01645 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01645 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01645 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P01645 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01645 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01645 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01645 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01645 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P01645 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01645 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01645 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01645 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01645 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01645 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01645 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01645 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01645 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01645 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P01645 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01645 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01645 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P01645 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01645 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01645 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01645 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P01645 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01645 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01645 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01645 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01645 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01645 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
P01645 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01645 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01645 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01645 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01645 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01645 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01645 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
P01645 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01645 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01645 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01645 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01645 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P01645 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01645 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01645 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01645 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01645 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
P01645 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms