Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01641 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01641 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01641 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01641 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01641 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01641 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01641 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01641 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01641 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01641 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01641 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01641 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01641 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01641 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01641 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01641 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01641 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01641 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01641 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
P01641 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01641 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01641 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01641 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01641 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01641 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01641 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01641 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01641 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01641 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01641 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01641 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01641 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01641 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01641 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01641 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01641 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01641 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01641 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01641 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01641 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01641 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01641 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01641 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01641 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01641 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01641 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01641 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01641 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01641 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01641 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01641 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01641 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01641 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01641 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01641 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01641 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01641 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01641 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01641 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01641 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01641 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01641 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01641 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01641 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01641 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01641 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01641 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01641 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01641 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01641 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01641 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01641 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01641 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01641 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
P01641 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01641 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01641 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01641 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01641 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P01641 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01641 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01641 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01641 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01641 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms