Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lancl1O89112 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lancl1O89112 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lancl1O89112 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lancl1O89112 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lancl1O89112 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lancl1O89112 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms