Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad51dO55230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad51dO55230 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad51dO55230 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad51dO55230 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms