Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsm2O35900 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsm2O35900 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lsm2O35900 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lsm2O35900 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm2O35900 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm2O35900 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lsm2O35900 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm2O35900 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm2O35900 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm2O35900 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm2O35900 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lsm2O35900 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm2O35900 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm2O35900 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lsm2O35900 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm2O35900 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm2O35900 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lsm2O35900 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lsm2O35900 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lsm2O35900 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lsm2O35900 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lsm2O35900 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms