Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf12O35738 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf12O35738 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf12O35738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf12O35738 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf12O35738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf12O35738 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf12O35738 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf12O35738 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf12O35738 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf12O35738 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf12O35738 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf12O35738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf12O35738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf12O35738 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klf12O35738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms