Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Neurod4O09105 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Neurod4O09105 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod4O09105 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod4O09105 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Neurod4O09105 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Neurod4O09105 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod4O09105 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms