Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ncoa3O09000 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ncoa3O09000 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ncoa3O09000 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ncoa3O09000 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ncoa3O09000 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ncoa3O09000 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ncoa3O09000 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ncoa3O09000 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ncoa3O09000 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms