Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EllO08856 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EllO08856 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EllO08856 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EllO08856 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EllO08856 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EllO08856 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EllO08856 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EllO08856 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EllO08856 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EllO08856 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EllO08856 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EllO08856 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EllO08856 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EllO08856 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EllO08856 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EllO08856 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EllO08856 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EllO08856 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EllO08856 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EllO08856 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EllO08856 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EllO08856 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EllO08856 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EllO08856 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EllO08856 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EllO08856 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EllO08856 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EllO08856 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EllO08856 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EllO08856 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EllO08856 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EllO08856 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EllO08856 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EllO08856 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EllO08856 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EllO08856 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EllO08856 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EllO08856 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EllO08856 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EllO08856 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EllO08856 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EllO08856 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EllO08856 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EllO08856 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EllO08856 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EllO08856 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EllO08856 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EllO08856 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EllO08856 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EllO08856 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EllO08856 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EllO08856 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EllO08856 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EllO08856 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EllO08856 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EllO08856 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EllO08856 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EllO08856 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EllO08856 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EllO08856 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EllO08856 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EllO08856 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EllO08856 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EllO08856 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EllO08856 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EllO08856 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EllO08856 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EllO08856 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EllO08856 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EllO08856 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EllO08856 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EllO08856 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EllO08856 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EllO08856 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EllO08856 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EllO08856 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EllO08856 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EllO08856 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EllO08856 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EllO08856 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EllO08856 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EllO08856 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EllO08856 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EllO08856 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EllO08856 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EllO08856 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EllO08856 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EllO08856 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EllO08856 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms