Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3239L7N2D9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3239L7N2D9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3239L7N2D9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3239L7N2D9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3239L7N2D9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms