Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8653K9J7G2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8653K9J7G2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8653K9J7G2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8653K9J7G2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1575.5 ms