Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mfsd4b4J3QNS5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd4b4J3QNS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms