Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trip12G5E870 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trip12G5E870 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trip12G5E870 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip12G5E870 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip12G5E870 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip12G5E870 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip12G5E870 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms