Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
2610008E11RikG3X964 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
2610008E11RikG3X964 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
2610008E11RikG3X964 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
2610008E11RikG3X964 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
2610008E11RikG3X964 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
2610008E11RikG3X964 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
2610008E11RikG3X964 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms