Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh9F8VPK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdh9F8VPK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdh9F8VPK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdh9F8VPK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdh9F8VPK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdh9F8VPK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh9F8VPK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms