Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf212F6TQD1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf212F6TQD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf212F6TQD1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf212F6TQD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms