Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss56F2YMG0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss56F2YMG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss56F2YMG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prss56F2YMG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prss56F2YMG0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms