Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cald1E9QA15 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cald1E9QA15 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cald1E9QA15 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cald1E9QA15 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cald1E9QA15 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cald1E9QA15 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cald1E9QA15 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cald1E9QA15 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cald1E9QA15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cald1E9QA15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Cald1E9QA15 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cald1E9QA15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms