Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Aldh3b2E9Q3E1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh3b2E9Q3E1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aldh3b2E9Q3E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms