Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C2cd2E9Q3C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C2cd2E9Q3C1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C2cd2E9Q3C1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2cd2E9Q3C1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2cd2E9Q3C1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2cd2E9Q3C1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms