Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt90E9Q1Z0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt90E9Q1Z0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt90E9Q1Z0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt90E9Q1Z0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt90E9Q1Z0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt90E9Q1Z0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms