Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms