Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr1E9Q0B4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdr1E9Q0B4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdr1E9Q0B4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr1E9Q0B4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr1E9Q0B4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdr1E9Q0B4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr1E9Q0B4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms