Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Fndc1E9Q043 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Fndc1E9Q043 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Fndc1E9Q043 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Fndc1E9Q043 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Fndc1E9Q043 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Fndc1E9Q043 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Fndc1E9Q043 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Fndc1E9Q043 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Fndc1E9Q043 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Fndc1E9Q043 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fndc1E9Q043 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Fndc1E9Q043 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fndc1E9Q043 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fndc1E9Q043 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fndc1E9Q043 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fndc1E9Q043 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fndc1E9Q043 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fndc1E9Q043 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms