Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkhd1E9PZ36 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkhd1E9PZ36 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkhd1E9PZ36 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkhd1E9PZ36 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms