Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Rsf1E9PWW9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rsf1E9PWW9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
Rsf1E9PWW9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rsf1E9PWW9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Rsf1E9PWW9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rsf1E9PWW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Rsf1E9PWW9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rsf1E9PWW9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Rsf1E9PWW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rsf1E9PWW9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms