Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Soga1E1U8D0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Soga1E1U8D0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Soga1E1U8D0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Soga1E1U8D0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Soga1E1U8D0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Soga1E1U8D0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Soga1E1U8D0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Soga1E1U8D0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Soga1E1U8D0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms