Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1110002E22RikE0CYV9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
1110002E22RikE0CYV9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
1110002E22RikE0CYV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
1110002E22RikE0CYV9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1110002E22RikE0CYV9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
1110002E22RikE0CYV9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1110002E22RikE0CYV9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1110002E22RikE0CYV9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1110002E22RikE0CYV9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1110002E22RikE0CYV9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
1110002E22RikE0CYV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1110002E22RikE0CYV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.5 ms